约翰汉蒙为了繁衍绝种的恐龙,在一座小岛使用化石残留的遗传基因,成功繁殖出各种恐龙,并在岛上兴建一座主题乐园侏罗纪公园,但是他原先的美意却严重失控,霸王龙和迅猛龙群起攻击岛上的人类,并造成多人惨死,八年后,波多黎各政府设法将岛上的恐龙全数消灭,并将这座世界仅有的恐龙栖息地全面封锁,不准任何人踏上小岛一步。
但是四年后,现在以大自然保护者自居的汉蒙却透露,另外有一座小岛被做为培育古代 恐龙 的第二实验地点,虽然当地的情况一度被控制住,但是在一次大风暴侵袭实验室之后,这些凶猛的史前掠食动物逃到野外,而令人意外的是,这些恐龙找到生存的方法,并在这个完美的生态环境里持续繁衍。
如今又过四年,第一位造访侏罗纪公园的古生物学家艾伦葛兰发现在这第二座小岛,被称为失落的世界的索纳岛上,隐藏着更大的凶险…